Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCBQ16585 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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