Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
VAMP3Q15836 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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