Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TAF1AQ15573 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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