Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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CNN3Q15417 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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CNN3Q15417 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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CNN3Q15417 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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CNN3Q15417 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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CNN3Q15417 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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CNN3Q15417 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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CNN3Q15417 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CNN3Q15417 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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