Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDK13Q14004 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDK13Q14004 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDK13Q14004 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDK13Q14004 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDK13Q14004 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDK13Q14004 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDK13Q14004 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDK13Q14004 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDK13Q14004 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDK13Q14004 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDK13Q14004 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms