Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
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PDE6HQ13956 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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PDE6HQ13956 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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PDE6HQ13956 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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PDE6HQ13956 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
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PDE6HQ13956 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PDE6HQ13956 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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