Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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