Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CLN3Q13286 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms