Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SEMA3BQ13214 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SEMA3BQ13214 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms