Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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NR1H3Q13133 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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NR1H3Q13133 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NR1H3Q13133 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NR1H3Q13133 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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NR1H3Q13133 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NR1H3Q13133 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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