Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN12Q05209 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms