Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
COPS7AQ9UBW8 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms