Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GDE1Q9NZC3 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms