Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
LHX9Q9NQ69 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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LHX9Q9NQ69 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LHX9Q9NQ69 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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