Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TRERF1Q96PN7 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms