Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
LAMA3Q16787 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
LAMA3Q16787 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms