Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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