Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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CNGA3Q16281 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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