Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.5 ms