Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF56Q15929 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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ZNF56Q15929 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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ZNF56Q15929 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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ZNF56Q15929 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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ZNF56Q15929 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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ZNF56Q15929 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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ZNF56Q15929 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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ZNF56Q15929 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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ZNF56Q15929 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF56Q15929 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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