Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NEDD8Q15843 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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