Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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TTF1Q15361 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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TTF1Q15361 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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TTF1Q15361 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TTF1Q15361 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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