Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HERPUD1Q15011 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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