Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms