Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RFTN1Q14699 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms