| RUNX2 | Q13950 | AC004160.1-212 | ENST00000421121 | 2078 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL591419.1-201 | ENST00000427423 | 339 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL31P35-201 | ENST00000431058 | 377 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND1P34-201 | ENST00000438556 | 671 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL26P6-201 | ENST00000440913 | 438 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL078581.2-201 | ENST00000446392 | 378 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL162389.1-201 | ENST00000449233 | 177 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AGTR1-208 | ENST00000475347 | 1669 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLS1-AS1-201 | ENST00000485338 | 346 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068305.1-201 | ENST00000497406 | 726 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KCTD9P5-201 | ENST00000504141 | 1170 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TNFAIP8-205 | ENST00000504642 | 711 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC105914.1-201 | ENST00000511798 | 226 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | IL7R-208 | ENST00000511982 | 612 nt | TSL 2 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010342.1-201 | ENST00000514047 | 877 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EGFLAM-AS2-202 | ENST00000514377 | 539 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP164-201 | ENST00000516533 | 110 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-64P-201 | ENST00000517119 | 105 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104393.1-201 | ENST00000517495 | 255 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SUMO2P20-201 | ENST00000520803 | 283 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090539.1-201 | ENST00000523907 | 434 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC022616.3-201 | ENST00000523940 | 148 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008489.1-201 | ENST00000524271 | 483 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02398-201 | ENST00000536666 | 431 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GLYCAM1-202 | ENST00000546607 | 553 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL049869.2-201 | ENST00000556634 | 365 nt | TSL 2 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC126407.1-201 | ENST00000563044 | 566 nt | TSL 4 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC026771.1-201 | ENST00000564672 | 415 nt | TSL 2 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL360157.1-201 | ENST00000565962 | 87 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LIVAR-201 | ENST00000578633 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC002546.1-201 | ENST00000588041 | 2504 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BNIP3P33-201 | ENST00000598912 | 569 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL109618.2-201 | ENST00000605527 | 211 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BRDTP1-201 | ENST00000605735 | 677 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CEP164P1-207 | ENST00000608660 | 504 nt | TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090970.3-201 | ENST00000612566 | 866 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL138686.1-201 | ENST00000612699 | 315 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005344.1-201 | ENST00000613391 | 459 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TUG1_2.1-201 | ENST00000614234 | 87 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL136313.1-201 | ENST00000624804 | 202 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TEX41-265 | ENST00000627785 | 704 nt | TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C18orf54-202 | ENST00000382911 | 4056 nt | TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OSBPL8-202 | ENST00000393249 | 7047 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TMPRSS11A-202 | ENST00000508048 | 3247 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM35DP-201 | ENST00000323387 | 2712 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM126A-204 | ENST00000432176 | 13177 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TLR8-202 | ENST00000311912 | 3367 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | STAU2-225 | ENST00000523558 | 1603 nt | TSL 2 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC118273.1-201 | ENST00000525324 | 3006 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP004289.2-201 | ENST00000444413 | 1457 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR1S2-201 | ENST00000302592 | 978 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR6C70-201 | ENST00000327335 | 939 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-511P-201 | ENST00000363496 | 107 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-76P-201 | ENST00000384060 | 104 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-432P-201 | ENST00000384196 | 109 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRAJ16-201 | ENST00000390521 | 60 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL109755.1-201 | ENST00000401791 | 649 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRPL42P2-201 | ENST00000403169 | 426 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.619-201 | ENST00000410951 | 90 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN1P24-201 | ENST00000412282 | 298 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL138826.1-202 | ENST00000415106 | 692 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS15AP12-201 | ENST00000419498 | 388 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRIM60P10Y-201 | ENST00000425589 | 751 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GCA-203 | ENST00000429691 | 824 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC024082.2-201 | ENST00000434771 | 238 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TRIM60P8Y-201 | ENST00000436338 | 762 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | USP9YP15-201 | ENST00000442391 | 422 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00302-201 | ENST00000444515 | 302 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR217HG-201 | ENST00000446139 | 900 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01069-201 | ENST00000452933 | 546 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NDUFAF4P4-201 | ENST00000454883 | 502 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN2P7-201 | ENST00000456186 | 273 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108059.3-201 | ENST00000456388 | 214 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GRM7-AS3-209 | ENST00000458713 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL9P32-201 | ENST00000464118 | 620 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCO2P29-201 | ENST00000465212 | 189 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079943.2-201 | ENST00000488999 | 716 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS15AP36-201 | ENST00000492022 | 382 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND4LP31-201 | ENST00000514859 | 294 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC084116.3-201 | ENST00000519123 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC105031.3-201 | ENST00000524359 | 616 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SDHAF2-203 | ENST00000534878 | 523 nt | TSL 2 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079584.2-201 | ENST00000548756 | 515 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARL1-211 | ENST00000551828 | 776 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02311-202 | ENST00000556819 | 477 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP005530.1-201 | ENST00000572608 | 567 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC098848.1-201 | ENST00000588466 | 567 nt | TSL 4 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC072046.2-201 | ENST00000618366 | 268 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006338.1-201 | ENST00000618453 | 749 nt | BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | THOC1-220 | ENST00000621904 | 1083 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003481.1-201 | ENST00000637808 | 351 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCNYL2-203 | ENST00000638057 | 730 nt | TSL 3 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GABRG2-213 | ENST00000639046 | 3058 nt | TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PPIP5K2-201 | ENST00000321521 | 15407 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 3.56 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MCF2-203 | ENST00000370576 | 3688 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TOP2A-201 | ENST00000423485 | 5758 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRO1804-201 | ENST00000623780 | 2050 nt | BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NEB-201 | ENST00000172853 | 20634 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ACADM-203 | ENST00000420607 | 1332 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX2 | Q13950 | WDFY3-AS2-202 | ENST00000451762 | 5814 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |