Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RUNX2Q13950 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms