Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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