Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BFSP2Q13515 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
BFSP2Q13515 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms