Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
TUBB3Q13509 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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TUBB3Q13509 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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TUBB3Q13509 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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TUBB3Q13509 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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