Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
FOXE3Q13461 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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