Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SF3B2Q13435 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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