Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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ITGB3BPQ13352 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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ITGB3BPQ13352 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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ITGB3BPQ13352 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
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ITGB3BPQ13352 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
ITGB3BPQ13352 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
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ITGB3BPQ13352 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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ITGB3BPQ13352 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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ITGB3BPQ13352 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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ITGB3BPQ13352 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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ITGB3BPQ13352 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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ITGB3BPQ13352 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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ITGB3BPQ13352 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ITGB3BPQ13352 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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