Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATMQ13315 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATMQ13315 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATMQ13315 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATMQ13315 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATMQ13315 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATMQ13315 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATMQ13315 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATMQ13315 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATMQ13315 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
ATMQ13315 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
ATMQ13315 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
ATMQ13315 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.22
ATMQ13315 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
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