Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SCGB2A2Q13296 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms