Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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