Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SEMA3FQ13275 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SEMA3FQ13275 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
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