Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CALCOCO2Q13137 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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CALCOCO2Q13137 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CALCOCO2Q13137 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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