Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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