Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PTP4A2Q12974 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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PTP4A2Q12974 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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PTP4A2Q12974 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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PTP4A2Q12974 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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PTP4A2Q12974 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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PTP4A2Q12974 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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PTP4A2Q12974 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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