Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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KCNMA1Q12791 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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KCNMA1Q12791 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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KCNMA1Q12791 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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KCNMA1Q12791 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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KCNMA1Q12791 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
KCNMA1Q12791 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
KCNMA1Q12791 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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