Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRDP23468 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms