Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
VPREB1P12018 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms