Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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