Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ZBED9Q6R2W3 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ZBED9Q6R2W3 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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