Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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