Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CSPP1Q1MSJ5 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CSPP1Q1MSJ5 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms