Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CDKN3Q16667 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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