Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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CTF1Q16619 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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CTF1Q16619 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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CTF1Q16619 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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CTF1Q16619 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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CTF1Q16619 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CTF1Q16619 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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