Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ECM1Q16610 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ECM1Q16610 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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