Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FXNQ16595 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms